Di sektor mesin, Yamaha R25 mengusung 250CC 4-tak, 8 valve DOHC Fuel Injection dengan pendingin cairan, sudah berstandar Euro 5+.
Tenaganya mencapai 26,4 kW pada 12.000 RPM dengan torsi maksimum 22,6 Nm pada 10.000 RPM.
Motor ini juga dibekali fitur Assist & Slipper Clutch yang membuat tuas kopling lebih ringan sekaligus mencegah roda belakang tergelincir, menjadikan pengalaman berkendara lebih halus dan aman, terutama saat bermanuver di perkotaan.
Sederet fitur canggih juga turut disematkan, seperti speedometer full digital yang menampilkan informasi berkendara secara lengkap, mulai dari kecepatan, putaran mesin, hingga indikator bahan bakar.
Selain itu, ada juga Y-Connect, fitur cangggih yang memungkinkan pengendara dapat menghubungkan motor ke ponsel.
Fitur ini dapat menampilkan notifikasi panggilan dan pesan langsung di layar speedometer, memantau status baterai dan bahan bakar, serta mendapatkan rekomendasi servis rutin dengan lebih mudah.